يُعد مركز الوثائق والمحفوظات أحد المراكز الهامة في جامعة طيبة، حيث يُعنى بجمع وثائق الجامعة ومُحفوظاتها وتنظيمها، إلى جانب حفظها وفهرستها وصيانتها، سواءً لأغراض الترحيل أو الإتلاف، وذلك وفقًا للوائح والأنظمة الصادرة من المركز الوطني للوثائق والمحفوظات.
