أُنشئت الإدارة العامة لشؤون المكتبات بجامعة طيبة مع نشأة الجامعة في عام 1424هـ، وتُعد مكتبة كلية التربية – التي أُسست عام 1397هـ – النواة الأولى لمنظومة مكتبات الجامعة الحالية. وتهدف الإدارة إلى نشر الوعي المعلوماتي وإثراء المعرفة داخل مجتمع الجامعة. وتؤدي الإدارة دورًا محوريًا في دعم الأنشطة العلمية والأكاديمية والبحثية من خلال توفير مصادر وأوعية معرفية متنوعة، سواء بصيغها التقليدية أو الإلكترونية، إضافة إلى معالجة وتنظيم المعلومات المتاحة وتقديمها لمنسوبي الجامعة من أعضاء هيئة التدريس والطلاب والإداريين والفنيين، وكذلك لرواد المكتبة والباحثين من داخل الجامعة وخارجها. تشرف الإدارة بشكل مباشر على جميع مكتبات الجامعة، المركزية منها في شطري الطلاب والطالبات، ومكتبات الكليات الفرعية. ويبلغ عدد مكتبات الجامعة حاليًا (17 مكتبة). كما تعمل الإدارة على توثيق وحصر الإنتاج الفكري لمنسوبي الجامعة بهدف تشجيع الإنتاج العلمي وتبادله مع الجامعات الأخرى، وتسعى إلى بناء وتطوير مستودع رقمي للإنتاج الفكري للجامعة لتنظيمه ونشره وتبادله بفاعلية. ومنذ تأسيسها، شرعت الإدارة في ميكنة المكتبات وأتمتة الإجراءات الفنية وتطبيق أنظمة الفهرسة الآلية الحديثة، حيث استقطبت في عام 1424هـ أحد الخبراء في الفهرسة الآلية لتدريب العاملين بالمكتبة ونقل الخبرة للكوادر الوطنية. وابتداءً من عام 1430هـ، قامت بتطوير وإنشاء عدد من المكتبات الفرعية بالكليات المؤسسة والجديدة لتلبية احتياجات العملية التعليمية من المعلومات. واليوم، وبعد استكمال ميكنة جميع العمليات الفنية والخدمات، تركز الإدارة جهودها على توفير الأوعية الإلكترونية، ورقمنة المقتنيات، وبناء المستودع الرقمي للإنتاج الفكري للجامعة ومنسوبيها.